系統分為監控系統和管理系統兩部分。其中信息管理系統按照“分層管理、逐級上報、科學監控”的原則設計，根據不同管理部門的不同要求與特點，省、市、縣各級環保管理部門根據不同的管理權限可接收到不同的污染源數據。
各級管理平臺可以利用下位機中安裝在污染源現場的數據采集儀智能控制下位在線監測分析儀的工作，并將數據處理后通過有線或無線方式實時傳送到平臺，供相關環保管理部門決策。

污染源在線監控軟件是專為環境管理部門而開發，該軟件基于NET開發平臺，其特點為：一是軟件變服務，二是基于XML的共同語言，三是融合多種設備和平臺，四是新一代的人機界面，利用Int網進行數據交換是目前較先進軟件構架。
功能要點
本地監控點信息管理
1、提供監控點基本信息的輸入、修改等編輯
2、污染物信息管理
3、環保、污染設備管理
監測參數設置
1、對系統的運行參數進行設置，包括監測項目、項目單位、量程上限、量程下限、上限報警值、下限報警值等
2、各參數的計算公式及數據小數點位置確定
數據采集
1、對監控點各傳感器數據進行采集
2、實時采集起到實時監控的作用，采集間隔時間可以設置
3、各實時數據每分鐘保存一次，并以表格和曲線等多種方式顯示
數據上報
1、根據監控部門需要上報監控點的排污數據
2、根據監控部門提供的數據折算公式上報從分鐘折算成小時后的數據
3、手動或自動上報數據，系統默認狀態為自動上報
4、自動上報時出現沖突或中斷，系統默認狀態為自動上報
5、上報設備運行效率
等比例采樣管理
1、根據監控部門的需要，對排污口的污水進行采樣
2、如果污水流量報警，系統自動對排污口的污水進行采樣
3、采樣成功對采樣日志做已采樣標記，填寫采樣時間
接受遠程控制
1、監控信息管理系統發送：等比例采樣、補登報表、補登設備運行效率等命令，本系統根據各命令完成相應的任務
2、監控點校時
自動報警
污染物濃度標、污染物濃度超出規定上下限報警值統計分析
統計分析
1、分鐘表、十分鐘表、小時表（以分鐘計，有平均值，最大值和最小值）
2、各種曲線、直方圖、園餅圖等
系統維護
權限設置、各種代碼表維護、操作員管理密碼修改等
手持式系統（PDA）
1、查看監測點監測值、環保設備和污染設備的工作狀態
2、遠程進行比例采樣。此項功能是為環境監察部門設計的，無論監察人員身處何地，當他發現某監測點的實時值不正常時，就可以給PDA服務系統發送比例采樣命令完成比例采樣任務